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高分期刊文献的中文解读，带原文图。按公众号体拆开：背景、问题、路线、亮点、数据和代码。 原文来自开放获取论文，文末标注作者、DOI 与许可，详见版权声明。
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IF36.1｜Spotiphy实现全切片单细胞空间全转录组
Spotiphy将测序型空间转录组提升至单细胞分辨率，同时保留全基因组覆盖。
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IF50.5｜肝星状细胞通过RSPO3调控肝分区、大小与功能
肝星状细胞不仅是纤维化元凶，还通过RSPO3维持肝脏代谢分区与再生。
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IF58.7｜免疫治疗驱动AD患者小胶质细胞清除Aβ的机制
空间转录组揭示主动与被动Aβ免疫后，小胶质细胞APOE和TREM2上调与Aβ清除相关。
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IF36.1｜Cell2fate：基于RNA速度模块提升细胞命运预测
用可解析的线性化模块分解RNA速度，在复杂动态和稀有细胞类型中更准地推断细胞轨迹。
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IF50.5｜胰腺癌重编程神经元的单细胞解析
Trace-n-Seq揭示胰腺癌如何劫持神经，去神经增敏免疫治疗。
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IF50.5｜转录组相似的神经元在功能与形态上存在地形差异
斑马鱼视顶盖中，同一转录组类型的神经元因空间位置不同而呈现功能与形态多样性。
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IF50.5｜人类下丘脑时空细胞图谱HYPOMAP
433,369个单核转录组+空间转录组，首次系统解析人类下丘脑细胞构成与肥胖遗传关联。
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IF31.7｜空间转录组揭示肺纤维化远端重塑的分子微环境失调
用空间转录组在单细胞分辨率下重建肺纤维化分子病理进程，发现上皮失调先于结构重塑。
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IF46.9｜人肝机器灌注下单细胞解析AAV衣壳嗜性与分区
AAV-LK03在正常人肝中高效特异转导门静脉周肝细胞，脂肪变性改变衣壳分区偏好。
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IF50.5｜moscot：多模态单细胞最优传输框架
一个可扩展的多模态最优传输框架，统一了单细胞时间、空间与时空映射。
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IF50.5｜肠道TRM细胞多样性由空间位置时空印记
小肠不同解剖位置通过局部信号塑造CD8 TRM细胞的功能异质性。
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IF36.1｜Astral质谱单细胞蛋白质组突破5300蛋白深度
Orbitrap Astral质谱仪将单细胞蛋白质组覆盖提升至5300个蛋白，并实现高精度定量。
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IF36.1｜Chip-Tip工作流实现单细胞蛋白质组深度与通量双突破
单细胞蛋白质组学新方法Chip-Tip在HeLa细胞中鉴定超过5000种蛋白质，并实现每日120个样本的高通量。
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IF50.5｜植物免疫中罕见的PRIMER细胞状态
单细胞多组学揭示植物免疫激活中心存在罕见PRIMER细胞，由GT-3A调控。
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IF31.7｜LEMUR：无需聚类即可分析多条件单细胞差异表达
用连续潜空间替代离散聚类，LEMUR让差异表达分析不再受限于细胞分群。
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IF31.7｜SPRINTER揭示肿瘤克隆增殖异质性及演化动态
SPRINTER算法利用单细胞全基因组测序，首次在克隆水平解析肿瘤增殖异质性及其与转移播散的关系。
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IF31.7｜单细胞多组学揭示复杂核型AML动态克隆演化与可靶向表型
单细胞多组学首次系统解析CK-AML的克隆演化模式与LSC药物敏感性，为靶向治疗提供新思路。
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IF31.7｜空间与单核转录组揭示阿尔茨海默病亚型的分子差异
整合空间转录组与单核测序，揭示DSAD与散发性AD的共享及独特病理机制。
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IF36.1｜CelloType：空间组学图像分割与分类的统一模型
一个Transformer多任务学习框架，同时搞定细胞分割和分类，精度全面超越现有方法。
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IF50.5｜人类胸腺空间图谱：连续组织轴揭示T细胞发育微环境
用连续组织轴整合多模态数据，揭示胸腺T细胞发育的空间逻辑。
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IF50.5｜人类胚胎骨骼发育的多组学图谱
单细胞多组学揭示人类胚胎骨与关节形成的细胞状态和调控网络。
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IF50.5｜单细胞整合揭示炎症性肠病中的幽门腺化生
1.6百万细胞图谱揭示肠道炎症中干细胞起源的化生细胞，兼具修复与促炎双重角色。
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IF58.7｜人类血管细胞跨器官单细胞图谱
整合19个器官约6.7万个血管细胞，揭示42种细胞状态及器官特异性分子特征。
IF58.7｜马拉维致命新冠肺的空间单细胞图谱揭示独特细胞特征
非洲队列新冠肺病理由IFN-γ驱动，与欧美队列的I/III型干扰素机制截然不同。