周启涛生物技术工作室

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高分期刊文献的中文解读,带原文图。按公众号体拆开:背景、问题、路线、亮点、数据和代码。 原文来自开放获取论文,文末标注作者、DOI 与许可,详见版权声明

IF36.1|BACS实现全转录组假尿苷绝对定量与单碱基测序(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2024/09/30

IF36.1|BACS实现全转录组假尿苷绝对定量与单碱基测序

新化学方法BACS让假尿苷检测从模糊走向精准,全面改写人类转录组Ψ图谱。

IF36.1|Vitessce:多模态与空间单细胞数据的一体化可视化框架(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2024/09/27

IF36.1|Vitessce:多模态与空间单细胞数据的一体化可视化框架

一个开源网页框架,让多模态、空间单细胞数据在多个联动视图中同时探索。

IF36.1|UnitMatch:基于波形跨天追踪神经元(原文图,详见文章页署名)

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神经科学2024/09/27

IF36.1|UnitMatch:基于波形跨天追踪神经元

仅凭平均波形即可跨天追踪神经元,性能媲美人工,速度远超现有方法。

IF50.5|森林火灾面积越大,火后地表升温越强(原文图,详见文章页署名)

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其他前沿2024/09/25

IF50.5|森林火灾面积越大,火后地表升温越强

大火不仅烧得猛,还会让火后夏季地表持续增温更久。

IF50.5|单细胞图谱揭示2型功能驱动CAR T细胞8年持久缓解(原文图,详见文章页署名)

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单细胞与空间2024/09/25

IF50.5|单细胞图谱揭示2型功能驱动CAR T细胞8年持久缓解

2型细胞因子功能是CAR T细胞超长持久性的关键,IL-4可重振低2型产品疗效。

IF50.5|蛋白质稳定性的遗传架构:加性能量模型即可高精度预测(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2024/09/25

IF50.5|蛋白质稳定性的遗传架构:加性能量模型即可高精度预测

在超过10^10的序列空间中,蛋白质稳定性遗传架构出奇简单,可解释能量模型即可准确预测。

IF31.7|深度集合网络整合变异注释提升罕见变异关联检验(原文图,详见文章页署名)

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基因组与遗传2024/09/25

IF31.7|深度集合网络整合变异注释提升罕见变异关联检验

DeepRVAT用深度集合网络学习基因损伤评分,大幅提升罕见变异关联发现与表型预测。

IF50.5|人脑海马和内嗅皮层神经元编码经验的时间结构(原文图,详见文章页署名)

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神经科学2024/09/25

IF50.5|人脑海马和内嗅皮层神经元编码经验的时间结构

单神经元活动逐渐嵌入序列图结构,形成预测性表征。

IF31.7|UKB全基因组、外显子组与插补策略的遗传关联产出比较(原文图,详见文章页署名)

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基因组与遗传2024/09/25

IF31.7|UKB全基因组、外显子组与插补策略的遗传关联产出比较

WGS比WES+IMP多测5倍变异,但关联信号仅多1%,样本量才是关键。

IF36.1|神经时空模型消除多帧成像运动伪影(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2024/09/24

IF36.1|神经时空模型消除多帧成像运动伪影

NSTM联合重建场景与运动,无需预训练即可从多帧原始数据中恢复动态过程。

IF31.7|多祖先队列揭示常染色体隐性变异对发育障碍的贡献(原文图,详见文章页署名)

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单细胞与空间2024/09/23

IF31.7|多祖先队列揭示常染色体隐性变异对发育障碍的贡献

已知ARDD基因解释84%隐性负担,解读错义变异比发现新基因更能提升诊断率。

IF31.7|自维持3D上皮样培养揭示食管上皮克隆扩张驱动基因(原文图,详见文章页署名)

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基因组与遗传2024/09/23

IF31.7|自维持3D上皮样培养揭示食管上皮克隆扩张驱动基因

无需传代可维持1年的上皮样培养,结合CRISPR筛选,系统解析食管上皮克隆竞争与适应性调控网络。

IF58.7|BEACON CRC分子图谱揭示BRAF-V600E突变型mCRC的耐药机制与免疫关联(原文图,详见文章页署名)

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肿瘤与免疫2024/09/23

IF58.7|BEACON CRC分子图谱揭示BRAF-V600E突变型mCRC的耐药机制与免疫关联

最大规模BRAF-V600E突变型mCRC分子分析,揭示获得性耐药图谱及免疫微环境对靶向治疗获益的差异化影响。

神经科学2024/09/20

IF36.1|模块化化学遗传钙指示剂实现多色在体功能成像

WHaloCaMP用染料配体与蛋白传感器模块化组装,实现绿光到近红外多色钙成像。

肿瘤与免疫2024/09/20

IF58.7|神经活性药物高通量筛选揭示胶质母细胞瘤治疗新靶点

抗抑郁药沃替西汀可协同化疗抑制胶质母细胞瘤,AP-1/BTG通路是关键。

IF36.1|基因级单细胞轨迹对齐框架 Genes2Genes(原文图,详见文章页署名)

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单细胞与空间2024/09/19

IF36.1|基因级单细胞轨迹对齐框架 Genes2Genes

新框架 Genes2Genes 可在单基因水平对齐单细胞轨迹,精准捕捉匹配与错配。

IF50.5|一步法:从氧化物直接制备块体合金(原文图,详见文章页署名)

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其他前沿2024/09/18

IF50.5|一步法:从氧化物直接制备块体合金

用氢气一步还原氧化物,直接得到块体因瓦合金,零碳排放且性能媲美传统工艺。

IF50.5|18株共生菌群通过生态位竞争清除肠道肠杆菌科致病菌(原文图,详见文章页署名)

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微生物组与感染2024/09/18

IF50.5|18株共生菌群通过生态位竞争清除肠道肠杆菌科致病菌

健康人粪便中筛选的18株共生菌,通过竞争性消耗葡萄糖酸,有效抑制多重耐药肠杆菌科细菌。

IF50.5|BMP4时序调控小鼠胚胎与胚外发育(原文图,详见文章页署名)

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发育与进化2024/09/18

IF50.5|BMP4时序调控小鼠胚胎与胚外发育

同一信号BMP4,早期促PGC特化,晚期却限制其数量。

IF50.5|piRNA通路精准甲基化依赖SPOCD1-SPIN1双重认证(原文图,详见文章页署名)

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表观遗传2024/09/18

IF50.5|piRNA通路精准甲基化依赖SPOCD1-SPIN1双重认证

SPOCD1与SPIN1的互作是年轻LINE1元件甲基化的先决条件,构成piRNA通路的第二道认证。

IF31.7|系统解析结直肠癌风险位点的功能变异与靶基因(原文图,详见文章页署名)

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基因组与遗传2024/09/16

IF31.7|系统解析结直肠癌风险位点的功能变异与靶基因

整合多组学与高通量报告基因实验,为170个CRC风险位点锁定候选因果变异和208个靶基因。

IF31.7|植物转录调控新范式:TSS下游序列的位置依赖性增强子(原文图,详见文章页署名)

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基因组与遗传2024/09/12

IF31.7|植物转录调控新范式:TSS下游序列的位置依赖性增强子

植物增强子并非位置无关,TSS下游500 bp内的GATC基序以剂量依赖方式调控转录,效应跨物种保守。

IF31.7|多组学疾病预测模型MILTON赋能UKB遗传发现(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2024/09/11

IF31.7|多组学疾病预测模型MILTON赋能UKB遗传发现

用常规生物标志物和血浆蛋白预测3,213种疾病,并增强罕见变异关联分析。

IF50.5|古拉帕努伊基因组揭示韧性及与美洲的前欧洲接触(原文图,详见文章页署名)

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基因组与遗传2024/09/11

IF50.5|古拉帕努伊基因组揭示韧性及与美洲的前欧洲接触

15个古拉帕努伊人全基因组证实:1600年代无人口崩溃,且约1250-1430年与美洲原住民发生基因交流。

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