周启涛生物技术工作室

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高分期刊文献的中文解读,带原文图。按公众号体拆开:背景、问题、路线、亮点、数据和代码。 原文来自开放获取论文,文末标注作者、DOI 与许可,详见版权声明

IF50.5|小分子PZL-A恢复突变型线粒体DNA聚合酶γ活性(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/04/09

IF50.5|小分子PZL-A恢复突变型线粒体DNA聚合酶γ活性

变构激活剂PZL-A可恢复POLG突变体的持续合成能力,为线粒体病治疗带来新思路。

IF50.5|时间分辨冷冻电镜直接揭示肌球蛋白摆动杠杆机制(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/04/09

IF50.5|时间分辨冷冻电镜直接揭示肌球蛋白摆动杠杆机制

首次捕获肌球蛋白与肌动蛋白结合的预发力态结构,直接展示93°杠杆摆动。

IF50.5|靶向M蛋白的小分子抑制剂JNJ-9676抗新冠病毒(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/03/26

IF50.5|靶向M蛋白的小分子抑制剂JNJ-9676抗新冠病毒

JNJ-9676通过锁定M蛋白新构象,在仓鼠模型中显著降低病毒载量。

IF50.5|双色MINFLUX揭示核孔复合体进出口共用通道(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/03/19

IF50.5|双色MINFLUX揭示核孔复合体进出口共用通道

核孔复合体的进口与出口并非走独立路径,而是在同一环形区域重叠进行。

IF50.5|人源脂肪酸合酶缩合循环的结构动态(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/02/20

IF50.5|人源脂肪酸合酶缩合循环的结构动态

大旋转并非必需:FASN在缩合循环中ACP穿梭与两翼相对取向解耦。

IF50.5|UM171作为分子胶水诱导CRL3–HDAC1/2不对称组装降解CoREST(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/02/12

IF50.5|UM171作为分子胶水诱导CRL3–HDAC1/2不对称组装降解CoREST

UM171通过同时结合KBTBD4和HDAC1/2,并借助InsP6,形成双分子胶水驱动的E3-新底物复合物。

IF50.5|UM171与KBTBD4癌症新形态突变的趋同机制(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/02/12

IF50.5|UM171与KBTBD4癌症新形态突变的趋同机制

KBTBD4突变通过劫持HDAC1/2活性位点降解CoREST,与分子胶UM171机制趋同。

IF36.1|Foldseek-Multimer:蛋白复合物结构比对加速3-4个数量级(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/02/05

IF36.1|Foldseek-Multimer:蛋白复合物结构比对加速3-4个数量级

用叠加向量聚类替代链配对穷举,11小时完成570亿对复合物全对全搜索。

IF50.5|C端酰胺化标记蛋白经SCF–FBXO31降解(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/01/29

IF50.5|C端酰胺化标记蛋白经SCF–FBXO31降解

氧化损伤产生的C端酰胺化蛋白被FBXO31识别并清除,致病突变D334N则将其转向必需蛋白。

IF50.5|Rubisco单点突变生化景观图谱(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/01/22

IF50.5|Rubisco单点突变生化景观图谱

大规模平行筛选揭示Rubisco单点突变对CO2亲和力的影响,少数突变可显著提升亲和力。

IF50.5|工程化酶实现立体选择性亲核芳香取代(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/01/15

IF50.5|工程化酶实现立体选择性亲核芳香取代

定向进化出SNAr1.3酶,高效催化SNAr反应并实现>99%对映选择性。

IF50.5|哺乳动物运动纤毛轴丝的结构多样性(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/01/01

IF50.5|哺乳动物运动纤毛轴丝的结构多样性

精子鞭毛的轴丝远比上皮纤毛复杂,新增约30种精子特异蛋白。

IF50.5|RNase P RNA溶液构象空间全景图谱(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2024/12/18

IF50.5|RNase P RNA溶液构象空间全景图谱

AFM+深度学习首次直接观测RNA全构象空间,揭示刚性核心与柔性外周共存。

IF50.5|AFM结合深度神经网络解析RNA构象异质性(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2024/12/18

IF50.5|AFM结合深度神经网络解析RNA构象异质性

HORNET方法利用单分子AFM图像和深度神经网络,无需信号平均即可解析RNA多种构象结构。

IF50.5|伪对称蛋白纳米笼的分层设计(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2024/12/18

IF50.5|伪对称蛋白纳米笼的分层设计

打破严格对称限制,设计出迄今最大的计算设计蛋白纳米笼。

IF50.5|原位解析TRiC工作循环及PDCD5作为开放态辅因子(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2024/12/11

IF50.5|原位解析TRiC工作循环及PDCD5作为开放态辅因子

冷冻电子断层扫描揭示细胞内TRiC近乎满载折叠新生蛋白,PDCD5特异性结合开放态。

结构与蛋白质组2024/11/28

IF36.1|膜蛋白原位纳米盘提取平台及蛋白质组范围优化数据库

用聚合物库从细胞膜直接提取目标膜蛋白到天然纳米盘,并建立数据库指导最佳提取条件。

IF50.5|人源MCM双六聚体装载机制的结构解析(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2024/11/27

IF50.5|人源MCM双六聚体装载机制的结构解析

首次用纯化人源蛋白体外重建MCM双六聚体装载,揭示与酵母不同的ORC6非依赖途径。

结构与蛋白质组2024/10/24

IF36.1|冷冻电镜单颗粒重构中的元素定位新方法REEL

REEL分析将电子能量损失谱与单颗粒图像处理结合,实现冷冻生物大分子复合物的三维元素定位。

IF46.9|FLiP–MS实验标记库全局解析蛋白质复合物动态(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2024/10/16

IF46.9|FLiP–MS实验标记库全局解析蛋白质复合物动态

一种结合超滤与LiP–MS的新方法,可高通量、结构分辨地追踪蛋白质互作变化。

IF36.1|GlycoShape:秒级恢复糖蛋白天然构象的糖基化工具箱(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2024/10/14

IF36.1|GlycoShape:秒级恢复糖蛋白天然构象的糖基化工具箱

基于1毫秒分子动力学采样,GlycoShape数据库与Re-Glyco算法可快速重建糖蛋白结构,N-糖基化位点预测准确率达93%。

IF50.5|生物分子凝聚体介导内体膜弯曲与剪切(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2024/10/09

IF50.5|生物分子凝聚体介导内体膜弯曲与剪切

植物ESCRT组分FREE1通过液-液相分离形成凝聚体,无需ATP即可驱动内腔囊泡形成。

IF50.5|人源外泌体-核糖体超复合物结构揭示mRNA降解机制(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2024/10/09

IF50.5|人源外泌体-核糖体超复合物结构揭示mRNA降解机制

外泌体与核糖体直接物理偶联,形成瞬时超复合物,实现共翻译mRNA降解。

IF50.5|蛋白质稳定性的遗传架构:加性能量模型即可高精度预测(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2024/09/25

IF50.5|蛋白质稳定性的遗传架构:加性能量模型即可高精度预测

在超过10^10的序列空间中,蛋白质稳定性遗传架构出奇简单,可解释能量模型即可准确预测。

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