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高分期刊文献的中文解读，带原文图。按公众号体拆开：背景、问题、路线、亮点、数据和代码。 原文来自开放获取论文，文末标注作者、DOI 与许可，详见版权声明。
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IF36.1｜GeneAgent：自验证语言代理提升基因集分析准确性
让LLM自己查数据库验证输出，基因集功能注释的幻觉率显著下降。
IF46.9｜单细胞多基因风险评分解析复杂疾病细胞与分子异质性
scPRS将PRS计算推进到单细胞分辨率，同时提升风险预测并定位疾病关键细胞与基因。
IF46.9｜单细胞同时捕获染色质可及性与剪接揭示脑细胞状态与疾病失调
ScISOr-ATAC 在单个细胞中同时测量染色质可及性和剪接，发现同一细胞类型内不同细胞状态剪接模式不同。
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IF58.7｜司美格鲁肽改善MASH的多组学机制解析
司美格鲁肽通过减重和独立于减重的代谢炎症通路逆转MASH相关蛋白组。
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IF50.5｜病理导向多重成像实现疾病整合图谱
PathoPlex框架以亚细胞分辨率同时解析上百种蛋白，将空间蛋白组学推向疾病机制发现。
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IF58.7｜APOE ε4携带者跨神经退行性疾病共享免疫相关蛋白组改变
APOE ε4不仅与阿尔茨海默病相关，更是一种跨疾病的系统性免疫易感标志。
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IF58.7｜全球神经退行性疾病蛋白质组学联盟揭示血浆蛋白标志物与器官衰老模式
GNPC整合约2.5亿蛋白测量，发现跨AD、PD、FTD、ALS的疾病特异血浆蛋白变化及APOE ε4独立签名。
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IF36.1｜BEAST X：贝叶斯系统发育与系统动力学推断的新平台
BEAST X 大幅提升复杂进化模型的计算效率，让大规模病原体基因组分析成为可能。
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IF36.1｜点云旋转不变表示学习解析三维多片胞内结构
用点云和旋转不变自编码器，无监督提取可解释的胞内结构形态特征。
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IF31.7｜单细胞Micro-C揭示多增强子枢纽调控基因表达
scMicro-C以5kb分辨率解析单细胞三维基因组，发现启动子-增强子条纹结构及多增强子枢纽。
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IF36.1｜DIA蛋白质组工具FDR控制普遍失效
用entrapment框架系统评估主流DIA工具，发现蛋白水平FDR控制几乎全部失效。
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IF36.1｜CondenSeq高通量解析核凝聚体蛋白序列决定因素
大规模池化成像结合原位测序，系统揭示芳香族残基与净电荷驱动核凝聚体形成。
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IF46.9｜moPepGen：图算法全面解析非经典肽
moPepGen用图算法在分钟级生成非经典肽库，让多组学蛋白质组鉴定更全面。
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IF50.5｜紫杉醇生物合成新基因与FoTO1的发现
单核转录组新策略mpXsn破解紫杉醇通路，实现巴卡亭III异源合成。
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IF46.9｜miniQuant：整合长短读长实现基因异构体精准定量
用K值量化基因异构体定量难度，miniQuant融合长短读长，显著提升复杂基因的定量准确性。
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IF36.1｜QIScope：让活细胞生物发光成像突破灵敏度与视野限制
基于量子图像传感器的望远镜式显微镜，以更高分辨率、更大视野和动态范围实现活细胞生物发光成像。
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IF36.1｜OmiCLIP：视觉-组学基础模型桥接病理图像与空间转录组
用百万级病理图像-转录组配对数据训练基础模型，实现跨模态组织分析。
IF58.7｜多组学肿瘤分析指导黑色素瘤治疗可行性
116例黑色素瘤患者多组学分析，75%病例数据有助于治疗决策，难治性患者客观缓解率达38%。
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IF36.1｜SUM-seq实现百万细胞级单细胞染色质与RNA联合测序
一种超高通量单细胞多组学方法，可同时解析染色质可及性与基因表达，揭示基因调控动态。
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IF46.9｜DreaMS：自监督学习从百万级质谱中挖掘分子表征
不依赖标注库，直接从原始质谱中自监督学习分子结构表征，性能超越现有方法。
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IF50.5｜半胱氨酸缺乏驱动快速减重的代谢机制
半胱氨酸限制通过GSH与CoA双耗竭，触发应激信号与代谢重编程，实现一周减重30%。
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IF36.1｜物理驱动的自监督网络实现光场显微高速高保真三维重建
SeReNet让光场显微镜摆脱重建速度与保真度的两难，毫秒级完成近衍射极限三维重建。
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IF46.9｜组织特异蛋白关联图谱助力疾病基因优先级排序
用7811例人类活检蛋白质组数据，构建11个组织的蛋白关联图谱，揭示超25%关联具组织特异性。
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IF36.1｜环形反卷积：利用旋转对称性高效校正空间变化像差
仅需一张校准图，即可实现全场亚细胞级各向同性分辨率。