周启涛生物技术工作室

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高分期刊文献的中文解读,带原文图。按公众号体拆开:背景、问题、路线、亮点、数据和代码。 原文来自开放获取论文,文末标注作者、DOI 与许可,详见版权声明

IF50.5|线粒体DNA掺入核糖核苷酸驱动炎症(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2025/09/24

IF50.5|线粒体DNA掺入核糖核苷酸驱动炎症

核苷酸失衡导致mtDNA掺入rNMP,释放至胞质激活cGAS–STING,引发衰老相关炎症。

IF50.5|核斑点通过捕获自身mRNA实现凝聚倾向蛋白的集体稳态(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2025/09/24

IF50.5|核斑点通过捕获自身mRNA实现凝聚倾向蛋白的集体稳态

核斑点作为传感器,通过选择性捕获富含GA的多价mRNA,负反馈调控易凝聚蛋白剂量。

IF50.5|Holliday junction与ZMM蛋白反馈维持减数分裂交叉保障(原文图,详见文章页署名)

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基因组与遗传2025/09/24

IF50.5|Holliday junction与ZMM蛋白反馈维持减数分裂交叉保障

重组中间体dHJ不仅是被动修复产物,更是维持联会复合体和抑制新DSB的关键调控节点。

IF36.1|从常见到稀有:迁移学习建模25万种节肢动物(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2025/09/23

IF36.1|从常见到稀有:迁移学习建模25万种节肢动物

CORAL借常见物种信息,让稀有物种也能被有效建模与预测。

IF36.1|厚样品冷冻电镜新方法:tcBF-STEM 实现剂量高效成像(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/09/23

IF36.1|厚样品冷冻电镜新方法:tcBF-STEM 实现剂量高效成像

倾斜校正明场 STEM 在厚样品上实现 3–5 倍剂量效率提升,并重建出 7 Å 病毒颗粒结构。

IF36.1|GPU加速MMseqs2实现超快同源搜索(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2025/09/18

IF36.1|GPU加速MMseqs2实现超快同源搜索

MMseqs2-GPU在单蛋白搜索中比CPU方法快6倍,且成本最低。

IF50.5|mTORC1在溶酶体膜上激活的结构基础(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/09/17

IF50.5|mTORC1在溶酶体膜上激活的结构基础

溶酶体膜本身是整合生长因子与营养信号、实现mTORC1高效激活的关键结构平台。

IF50.5|感知决策中动态机制与神经模式的转换(原文图,详见文章页署名)

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神经科学2025/09/17

IF50.5|感知决策中动态机制与神经模式的转换

决策承诺是内部状态的一次快速、协调切换,而非外部事件锁定的过程。

IF50.5|生成式Transformer学习人类疾病自然史(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2025/09/17

IF50.5|生成式Transformer学习人类疾病自然史

Delphi-2M用GPT架构同时预测千余种疾病风险,并可采样未来健康轨迹。

IF50.5|利用蛋白-代谢物共变发现LRRC58调控半胱氨酸分解(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2025/09/17

IF50.5|利用蛋白-代谢物共变发现LRRC58调控半胱氨酸分解

LRRC58作为E3泛素连接酶底物适配器,响应半胱氨酸水平降解CDO1,控制肝脏胆固醇。

IF50.5|青年运动员反复头部撞击引发神经元丢失与炎症(原文图,详见文章页署名)

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单细胞与空间2025/09/17

IF50.5|青年运动员反复头部撞击引发神经元丢失与炎症

反复头部撞击在CTE病理出现前已导致皮质神经元丢失和炎症。

IF50.5|MPO通过寡聚状态切换驱动染色质解聚与NET形成(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/09/17

IF50.5|MPO通过寡聚状态切换驱动染色质解聚与NET形成

MPO二聚体拆解核小体,单体则稳定结合,同一蛋白两种身份。

IF36.1|GHIST:从H&E图像深度学习预测单细胞空间基因表达(原文图,详见文章页署名)

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单细胞与空间2025/09/15

IF36.1|GHIST:从H&E图像深度学习预测单细胞空间基因表达

仅凭H&E染色图像,GHIST即可预测单细胞分辨率的空间基因表达,为TCGA等大型队列添加空间组学维度。

IF36.1|MSnLib:开源多级质谱谱图库的高效构建(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2025/09/15

IF36.1|MSnLib:开源多级质谱谱图库的高效构建

30,008个化合物、超230万张MSn谱图,开源多级质谱库MSnLib大幅扩展公共谱图资源。

IF36.1|Spacedust:基于结构比对从头发现微生物保守基因簇(原文图,详见文章页署名)

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基因组与遗传2025/09/15

IF36.1|Spacedust:基于结构比对从头发现微生物保守基因簇

用Foldseek结构比对+统计检验,在1308个细菌基因组中找回95%的已知防御系统。

IF36.1|肿瘤微生物组:从测序数据到可靠发现的挑战与机遇(原文图,详见文章页署名)

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微生物组与感染2025/09/15

IF36.1|肿瘤微生物组:从测序数据到可靠发现的挑战与机遇

肿瘤微生物组研究正处转折点,本文系统梳理证据、挑战与最佳实践。

IF36.1|基于生物物理模拟的蛋白质语言模型METL(原文图,详见文章页署名)

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结构与蛋白质组2025/09/11

IF36.1|基于生物物理模拟的蛋白质语言模型METL

用Rosetta模拟数据预训练蛋白质语言模型,再结合少量实验数据微调,在低数据量和外推任务中表现优异。

IF50.5|宇宙学模拟揭示球状星团与类球状星团矮星系的新形成机制(原文图,详见文章页署名)

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其他前沿2025/09/10

IF50.5|宇宙学模拟揭示球状星团与类球状星团矮星系的新形成机制

EDGE模拟同时涌现出球状星团、矮星系和一类全新的“类球状星团矮星系”,为暗物质和第一代恒星研究提供新线索。

IF31.7|DNA甲基化与基因组变异协同驱动NSCLC演化(原文图,详见文章页署名)

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表观遗传2025/09/10

IF31.7|DNA甲基化与基因组变异协同驱动NSCLC演化

表观遗传与遗传变异并非独立,而是通过剂量补偿和染色质变构协同塑造肺癌演化。

IF36.1|CLEM-Reg:基于点云自动配准的体积光电关联新算法(原文图,详见文章页署名)

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多组学与方法2025/09/10

IF36.1|CLEM-Reg:基于点云自动配准的体积光电关联新算法

用线粒体分割点云自动配准,将vCLEM对齐从2小时缩短到几分钟,精度接近专家手动。

IF50.5|神经元活动驱动小细胞肺癌发生与脑内进展(原文图,详见文章页署名)

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神经科学2025/09/10

IF50.5|神经元活动驱动小细胞肺癌发生与脑内进展

SCLC在肺内依赖迷走神经支配,在脑内则通过谷氨酸能和GABA能突触输入促进生长。

IF50.5|可编程反义寡核苷酸实现噬菌体功能基因组学(原文图,详见文章页署名)

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微生物组与感染2025/09/10

IF50.5|可编程反义寡核苷酸实现噬菌体功能基因组学

外源递送ASO沉默噬菌体mRNA,绕过遗传操作限制,系统鉴定ΦKZ必需基因。

IF50.5|小细胞肺癌劫持神经元突触信号促生长(原文图,详见文章页署名)

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肿瘤与免疫2025/09/10

IF50.5|小细胞肺癌劫持神经元突触信号促生长

SCLC细胞可与神经元形成功能性突触,并依赖谷氨酸信号获得增殖优势。

IF50.5|能量不足选择拥挤上皮活细胞挤出(原文图,详见文章页署名)

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其他前沿2025/09/10

IF50.5|能量不足选择拥挤上皮活细胞挤出

拥挤上皮中,ATP最低的细胞被ENaC探针选中,经去极化、皱缩后挤出。

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