周启涛生物技术工作室
单细胞与空间2025/09/17· 编译自 Nature

IF50.5|青年运动员反复头部撞击引发神经元丢失与炎症

反复头部撞击在CTE病理出现前已导致皮质神经元丢失和炎症。

反复头部撞击在CTE病理出现前已导致皮质神经元丢失和炎症。

这篇按生信解读号的读法拆:先看背景和问题,再看作者怎么做、做出了哪几条硬发现,最后把数据和代码收走。

研究背景

慢性创伤性脑病(CTE)是一种由反复头部撞击(RHI)引起的进行性tau蛋白病,常见于接触性运动人群。目前CTE只能在死后通过尸检确诊,且早期症状与tau蛋白沉积程度并不完全一致。已有研究表明,RHI暴露与星形胶质细胞活化、白质炎症、血脑屏障破坏及血管密度增加有关,但这些细胞表型的全面特征尚不清楚。在年轻运动员中,RHI暴露的长期后果日益受到关注,但早期细胞变化尚未被系统描述。

科学问题

卡在哪里: 此前研究多聚焦于老年重症CTE患者,对年轻RHI暴露者早期细胞变化了解有限。CTE诊断依赖死后tau蛋白病理,但早期症状无法用tau沉积解释。此外,RHI暴露后微胶质细胞、内皮细胞和神经元的具体转录组改变及其与暴露年限的关系尚不清楚。

本文要回答: 本文旨在揭示年轻RHI暴露者(<51岁)在CTE tau病理出现前的多细胞转录组变化,并验证其与暴露年限的相关性。

技术路线

作者主要用了:snRNA-seq、免疫组化、RNAscope原位杂交、Nissl染色、MultiNicheNet配体-受体分析

作者收集了28例年轻个体(8例对照、9例RHI暴露无CTE、11例低分期CTE)的背外侧前额叶皮质沟底灰质组织,进行单核RNA测序。通过无监督聚类鉴定细胞类型,并利用差异表达分析、基因模块分析和配体-受体分析识别RHI相关变化。随后用免疫组化、RNAscope原位杂交和Nissl染色在独立队列中验证关键发现,并关联暴露年限。

Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用

图 1 Fig. 1。图1展示了实验流程和细胞类型鉴定。a图显示从28例个体获取背外侧前额叶皮质沟底灰质进行snRNA-seq的流程;b图AT8免疫组化显示CTE特征性tau病理;c图UMAP展示所有细胞核的聚类结果,标注了主要细胞类型;d图显示各细胞类型比例在病理组间无显著差异。

核心亮点

亮点 1|RHI诱导炎症性微胶质细胞亚型

微胶质细胞聚类分析发现11个亚群,其中三个亚群(RHIM1-3)在RHI暴露组和CTE组中富集,而对照组以稳态微胶质细胞为主。RHIM2和RHIM3高表达SPP1、HIF1A、TLR2等炎症基因,且与暴露年限正相关。原位杂交证实SPP1+HIF1A+微胶质细胞在皮质沟底随足球运动年限增加而增多,且不依赖于tau病理。这些结果表明RHI暴露足以诱导微胶质细胞向炎症状态转变,可能参与早期神经炎症。

Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用

图 2 Fig. 2。图2聚焦微胶质细胞亚型。a图UMAP显示11个微胶质细胞簇;b图热图展示各簇特征基因;c图显示RHIM1-3在RHI和CTE组中富集,而稳态微胶质细胞在对照组中富集;d图UMAP按病理组着色,突出RHIM2/3;e图hdWGCNA模块分析显示Turquoise模块在RHIM2/3中富集。

亮点 2|内皮细胞血管生成与炎症反应

内皮细胞亚群分析显示,Cap2和Cap4毛细血管亚型在RHI和CTE组中富集,且Cap2比例随暴露年限增加。这些亚型上调HIF1A、ANGPT2、ICAM1等血管生成和炎症相关基因,以及补体调节基因CD59、CD55、CD46。原位杂交证实ITGAV+血管比例随暴露年限增加。这些发现提示RHI暴露导致毛细血管内皮细胞活化,可能促进血脑屏障功能障碍和局部缺氧。

Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用

图 3 Fig. 3。图3展示内皮细胞亚型变化。a图UMAP显示内皮细胞亚群,箭头指示RHI和CTE富集的簇;b图堆叠条形图显示Cap2和Cap4在RHI和CTE组中比例增加;c图点图展示血管生成和炎症相关基因在Cap2和Cap4中上调;d图小提琴图显示Celda模块表达差异。

亮点 3|皮质2/3层兴奋性神经元丢失

snRNA-seq分析显示,RHI暴露组和CTE组中CUX2+LAMP5+兴奋性神经元比例显著低于对照组,平均减少56%。该丢失与足球运动年限相关,且不依赖于tau病理。原位杂交和Nissl染色在独立队列中验证了这一发现,并显示丢失特异性地发生在皮质沟底而非脑回顶部。此外,神经元密度与稳态微胶质细胞密度正相关,提示微胶质细胞稳态丧失可能伴随神经元丢失。

Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用

图 4 Fig. 4。图4展示兴奋性神经元亚型和丢失。a图UMAP显示兴奋性神经元分层亚型;b图韦恩图显示RHI与CTE组间差异基因高度重叠;c图热图展示GO富集分析结果;d图条形图显示CUX2+LAMP5+神经元在RHI和CTE组中比例显著降低。

亮点 4|TGFβ1介导微胶质-内皮细胞通讯

MultiNicheNet配体-受体分析发现,在RHI暴露组中,微胶质细胞来源的TGFB1是重要的信号配体,其受体ITGAV和TGFBR2在内皮细胞中表达上调。原位杂交显示,ITGAV+TGFBR2+血管比例随暴露年限增加,且在CTE组中TGFB1+微胶质细胞与这些血管的邻近性增加。此外,ITGAV+TGFBR2+血管增多与神经元密度降低相关,提示该信号通路可能参与神经元丢失的病理过程。

Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用

图 5 Fig. 5。图5展示配体-受体分析和TGFβ1信号验证。a图Circos图显示微胶质细胞作为发送细胞的关键配体-受体对;b图RNAscope原位杂交显示TGFB1+微胶质细胞与ITGAV+TGFBR2+血管接触;c-d图显示ITGAV+TGFBR2+血管比例随暴露年限增加,而TGFB1+微胶质细胞比例无显著变化。

生信可带走

这一块是给做分析的人用的,不是科普点缀。

  • 方法栈: snRNA-seq、免疫组化、RNAscope原位杂交、Nissl染色、MultiNicheNet配体-受体分析
  • 公开数据: 原文未给出公开组学登录号
  • 代码: 原文未给出公开 GitHub/GitLab 仓库
  • 谁该点开原文: 从事神经退行性疾病、单细胞组学或运动医学研究的科研人员。

带走一句

RHI暴露在CTE病理出现前已驱动细胞类型特异性转录组变化,提示早期干预窗口。分析时需关注细胞亚型比例变化与暴露年限的关联,而非仅依赖病理分期。

本页供学习交流,不替代原文,也不代表原作者、期刊或资助方立场。引用科学结论请以正式发表版本为准。 图表按 CC BY(可转载,需署名) 使用。 版权声明

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