周启涛生物技术工作室
结构与蛋白质组2025/11/12· 编译自 Nature

IF50.5|MARV16:一种疫苗诱导的广谱抗马尔堡病毒中和抗体

稳定化MARV GP三聚体免疫原,发现广谱中和抗体MARV16,可治疗性保护豚鼠。

稳定化MARV GP三聚体免疫原,发现广谱中和抗体MARV16,可治疗性保护豚鼠。

这篇按生信解读号的读法拆:先看背景和问题,再看作者怎么做、做出了哪几条硬发现,最后把数据和代码收走。

研究背景

马尔堡病毒(MARV)属于丝状病毒科,引起马尔堡病毒病(MVD),病死率24-88%。近年来非洲多次暴发,但尚无获批疫苗或治疗药物。MARV糖蛋白(GP)是中和抗体和疫苗的唯一靶点,GP由GP1和GP2亚基组成,GP1含受体结合位点(RBS),被高度糖基化的glycan cap和mucin-like domain屏蔽。此前发现的RBS靶向抗体如MR78、MR191中和活性弱,且易被单点突变逃逸。GP的prefusion构象不稳定,限制了免疫原设计和抗体发现。

科学问题

卡在哪里: 已报道的MARV GP中和抗体均靶向RBS,中和效力弱(IC50>1 μg/ml),且单点突变即可逃逸。MARV GP的prefusion构象缺乏稳定化突变,导致免疫原性差,难以诱导强效中和抗体。此外,尚无针对MARV的抗体鸡尾酒疗法,因为缺乏靶向不同表位的中和抗体。

本文要回答: 鉴定MARV GP稳定化突变,开发高免疫原性prefusion三聚体,并从中发现强效广谱中和抗体,评估其体内保护效果及与RBS抗体的协同作用。

技术路线

作者主要用了:ProteinMPNN、冷冻电镜、BLI、假病毒中和、负染电镜、VSV逃逸筛选

作者首先设计缺失mucin-like domain和跨膜区的MARV GPΔMuc ectodomain,并引入已知促三聚体突变。随后利用ProteinMPNN在GP2 HR1C区域设计稳定化突变,通过表达量、热稳定性和免疫原性筛选出T582P/F583V双突变体(GPΔMucPV)。用该免疫原免疫人源化小鼠,分选GP特异性记忆B细胞,获得单克隆抗体,筛选出强效中和抗体MARV16。进一步通过冷冻电镜解析MARV16-GP复合物结构,阐明中和机制,并在豚鼠模型中验证治疗保护效果,最后评估与RBS抗体的协同逃逸屏障。

Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用

图 1 Fig. 1。图1展示MARV GP结构域示意图及稳定化突变设计。负染电镜显示GPΔMucWT和突变体均形成单分散三聚体。BLI证实突变体保留MR191结合。免疫原性实验显示GPΔMucPV诱导更高结合抗体滴度,但中和滴度无显著差异。

核心亮点

亮点 1|稳定化突变提升GP三聚体表达与免疫原性

通过ProteinMPNN设计HR1C区突变,发现T582P和F583V单突变分别提高表达1.6和1.7倍,双突变提高2.5倍,且热稳定性提高2.6°C。免疫BALB/c小鼠显示,GPΔMucPV诱导的血清结合抗体滴度比野生型高1.9-4.0倍,但中和滴度无显著差异。这表明稳定化prefusion三聚体是更优的疫苗免疫原。

Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用

图 2 Fig. 2。图2展示MARV16的发现和中和活性。免疫方案、假病毒中和曲线显示MARV16 IC50远低于MR78和MR191。对7株MARV分离株及RAVV、DEHV的广谱中和数据,以及BLI亲和力测定和pH依赖性结合。

亮点 2|MARV16:强效广谱中和抗体

从免疫GPΔMucWT的人源化小鼠中分离到MARV16,其对MARV/Musoke假病毒IC50为36.4 ng/ml,比MR78和MR191强42和39倍。对7株历史及当代MARV分离株IC50为151-310 ng/ml,并中和RAVV和DEHV,但不中和EBOV或SUDV。MARV16结合亲和力Kd=1.35 nM,且pH 4.5-7.4范围内结合稳定。

Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用

图 3 Fig. 3。图3展示MARV16 Fab与MARV GP复合物的冷冻电镜结构。整体结构显示三个Fab结合三聚体,细节图展示CDR与GP1/GP2的相互作用。与NPC1结合模型比较显示空间位阻。

亮点 3|冷冻电镜揭示MARV16识别prefusion特异性表位

2.6 Å结构显示MARV16 Fab结合GP1-GP2界面,表位埋藏面积1100 Ų,75%由GP2贡献。CDRH1-3和CDRL3与GP2形成广泛氢键和盐桥,CDRH2与GP1相互作用。该表位在MARV、RAVV、DEHV中保守,解释了广谱中和活性。结构还显示MARV16会与NPC1受体结合位点空间冲突,阻断受体结合。

Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用

图 4 Fig. 4。图4展示豚鼠攻毒实验设计及结果。生存曲线显示MARV16治疗组存活率显著高于对照组,病毒载量降低,体重和临床评分改善。

亮点 4|MARV GP glycan cap结构解析

冷冻电镜密度解析了GP1 glycan cap残基191-219,显示其通过β-strand augmentation和F212插入RBS,与EBOV GP类似,但锚定更松散,可能更易被置换。这解释了为何RBS抗体能中和MARV但不能中和EBOV。

Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用

图 5 Fig. 5。图5展示抗体竞争结合和逃逸筛选。BLI显示MARV16与MR78/MR191可同时结合。负染电镜显示六个Fab同时结合三聚体。逃逸突变图谱显示鸡尾酒需要多个突变。

亮点 5|MARV16在豚鼠模型中提供治疗性保护

豚鼠攻毒MARV/Angola后1、2、4天给予MARV16,存活率分别为33%、83%和50%(排除血浆未检出抗体的动物后为50%、83%和60%)。治疗组病毒载量降低1-3 log,临床评分改善。MARV16不激活FcγRIIa或FcγRIIIa,表明保护主要来自直接中和。

亮点 6|抗体鸡尾酒提高逃逸屏障

MARV16与MR78或MR191可同时结合GP三聚体。VSV-MARV/Musoke GP逃逸筛选显示,单独MARV16仅需单点突变A514T即可逃逸,而MARV16+MR78或MARV16+MR191鸡尾酒需要2-3个突变才能逃逸。这些突变位于GP2 core、glycan cap、wing或RBS,表明鸡尾酒能显著提高耐药屏障。

生信可带走

这一块是给做分析的人用的,不是科普点缀。

  • 方法栈: ProteinMPNN、冷冻电镜、BLI、假病毒中和、负染电镜、VSV逃逸筛选
  • 公开数据: 原文未给出公开组学登录号
  • 代码: 原文未给出公开 GitHub/GitLab 仓库
  • 谁该点开原文: 从事病毒疫苗设计、抗体发现和结构生物学的生信与免疫学研究者。

带走一句

稳定化prefusion GP三聚体是发现强效中和抗体的关键,靶向GP1-GP2界面的抗体具有广谱中和潜力,鸡尾酒策略可提高耐药屏障。

本页供学习交流,不替代原文,也不代表原作者、期刊或资助方立场。引用科学结论请以正式发表版本为准。 图表按 CC BY(可转载,需署名) 使用。 版权声明

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