周启涛生物技术工作室
神经科学2025/12/02· 编译自 Nature Methods

IF36.1|CaBLAM:高对比度生物发光钙指示剂

CaBLAM以83倍体外对比度实现无光毒性、可长时间单细胞钙成像。

CaBLAM以83倍体外对比度实现无光毒性、可长时间单细胞钙成像。

这篇按生信解读号的读法拆:先看背景和问题,再看作者怎么做、做出了哪几条硬发现,最后把数据和代码收走。

研究背景

监测细胞内钙信号是理解细胞信号转导的核心。荧光基因编码钙指示剂(GECI)如GCaMP系列是活体钙成像的标准工具,但需要强激发光,导致光漂白、背景自发荧光和光毒性,限制了长期成像和自由活动动物的应用。生物发光GECI通过酶促反应产生光,无需激发光,但此前受限于低动态范围和钙亲和力不匹配,难以在生理钙浓度下实现高信噪比单细胞成像。

科学问题

卡在哪里: 现有生物发光钙指示剂(如GeNL(Ca2+)_480、CaMBI)在活细胞中对比度低(通常小于2倍),且钙亲和力过高或过低,无法在生理钙浓度范围内产生足够大的信号变化,限制了其在单细胞和亚细胞水平、长时间活体成像中的应用。

本文要回答: 开发一种高对比度、钙亲和力可调、适合活体长时间单细胞成像的生物发光钙指示剂。

技术路线

作者主要用了:定向进化、蛋白质工程、FRET、体外钙滴定、细胞培养、在体小鼠和斑马鱼成像

作者首先通过定向进化改造Oplophorus gracilirostris荧光素酶(OLuc),获得高活性、可溶性好的SSLuc支架。随后将SSLuc拆分并插入钙传感域(RS20-CaM),通过优化C端肽序列和钙调蛋白突变,构建CaBLAM。体外钙滴定确定其亲和力和对比度,然后在细胞系和原代神经元中与GeNL(Ca2+)_480及GCaMP8s对比,最后在清醒小鼠和斑马鱼中验证活体成像性能。

Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用

图 1 Fig. 1。图1展示CaBLAM的结构设计:a为eKL9h和CaBLAM的结构模型,黄色棍状表示相对于eKAZ的突变位点,品红色为C端肽;b为传感器组件架构,显示拆分荧光素酶与钙传感域的连接;c为体外钙滴定曲线,显示CaBLAM的KD约439 nM,对比度83倍,Hill系数2.6,优于GeNL和CaMBI。

核心亮点

亮点 1|SSLuc支架的开发

通过多轮定向进化,从eKAZ出发获得SSLuc,其体外活性比NanoLuc高数倍,且在哺乳动物细胞中不易聚集。SSLuc在Fz底物下表现最佳,但细胞内亮度受底物可用性限制。SSLuc适合插入传感域,成为构建高对比度生物发光传感器的理想支架。

Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用

图 2 Fig. 2。图2对比CaBLAM生物发光和GCaMP8s荧光在培养海马神经元中的成像。a和b为代表性成像视野和ROI,c和d为对应钙信号轨迹。CaBLAM基线低但刺激诱发ΔL/L明显,GCaMP8s基线高但ΔF/F相对较小,直观体现两种传感器的信号特性。

亮点 2|CaBLAM的体外高对比度

CaBLAM在体外对Ca2+的KD约为439 nM,Hill系数约2.6,饱和Ca2+与零Ca2+下的发光比(绝对对比度)达83倍,远高于GeNL(Ca2+)_480(约2.3倍)和CaMBI(约1倍)。通过钙调蛋白突变(如N98I)可调节亲和力,获得KD为3 μM和280 nM的变体。

Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用

图 3 Fig. 3。图3定量比较CaBLAM和GCaMP8s对1、5、40脉冲电刺激的响应。a和b为平均时间锁定轨迹,c显示CaBLAM的ΔL/L峰值显著高于GCaMP8s的ΔF/F,d和e显示CaBLAM响应更慢,f显示GCaMP8s的峰值SNR更高。表明CaBLAM在对比度上占优但动力学较慢。

亮点 3|细胞中对比度显著优于GeNL

在U2OS细胞中,CaBLAM对离子霉素刺激的对比度比GeNL(Ca2+)_480高5.4倍;在HeLa细胞中,组胺诱导的振荡幅度大3.3倍;在原代大鼠皮层神经元中,KCl去极化引起的生物发光增加约20倍,而GeNL(Ca2+)_480仅约4倍。CaBLAM的低基线发光和高Hill系数是其优势。

Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用

图 4 Fig. 4。图4展示清醒小鼠在体成像结果。a为实验装置,b为两种成像配置,c为平均投影图像,d为CaBLAM单细胞活动轨迹,e-j为响应细胞比例、波形、潜伏期和SNR比较,k和l为外周注射CFz后的群体反应。CaBLAM单次试验SNR显著高于GCaMP6s,且基线更稳定。

亮点 4|与GCaMP8s的神经元成像对比

在大鼠海马神经元中,CaBLAM在10 Hz成像下可检测单次动作电位引起的钙信号,ΔL/L变化大于GCaMP8s的ΔF/F(1次刺激P=1.1×10^-10)。但CaBLAM响应动力学较慢(峰值时间约700 ms vs GCaMP8s约100 ms),且GCaMP8s的峰值SNR更高。CaBLAM在4.6 μM Fz下响应更快更大。

Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用

图 5 Fig. 5。图5展示斑马鱼中CaBLAM的应用。a为星形胶质细胞表达,b-g为尾部运动与生物发光信号的关系,h-k为不同驱动系的响应动力学,l-n为低端相机成像结果,o-q为增强型相机高速成像和kymograph。证明CaBLAM可在清醒斑马鱼中监测神经元和胶质细胞的钙活动。

亮点 5|清醒小鼠单细胞SNR优于GCaMP6s

在NDNF-Cre小鼠中,CaBLAM在无激发光条件下实现单细胞分辨率成像,触觉刺激诱发的单次试验SNR显著高于GCaMP6s(P=1.89×10^-5),主要由于CaBLAM基线波动更小。CaBLAM响应起始潜伏期较GCaMP6s晚(中位数1 s vs 0.45 s)。外周注射CFz后,CaBLAM在2 Hz和10 Hz下均能检测到快速起始的群体反应。

亮点 6|长时间稳定成像与斑马鱼应用

CaBLAM在麻醉小鼠中单次给予FFz后,可稳定成像超过5小时,SNR不随时间显著下降。在斑马鱼中,CaBLAM在神经元和星形胶质细胞中表达,可检测尾部大幅运动引起的钙信号,不同驱动系表现出不同动力学。使用非制冷相机或增强型相机均可实现空间分辨成像。

生信可带走

这一块是给做分析的人用的,不是科普点缀。

  • 方法栈: 定向进化、蛋白质工程、FRET、体外钙滴定、细胞培养、在体小鼠和斑马鱼成像
  • 公开数据: 原文未给出公开组学登录号
  • 代码: 原文未给出公开 GitHub/GitLab 仓库
  • 谁该点开原文: 从事神经科学、钙成像、生物传感器开发或需要长时间活体成像的研究人员。

带走一句

CaBLAM证明通过优化荧光素酶支架和钙传感域,生物发光钙指示剂可以达到与荧光GECI相当的活体单细胞成像性能,且无光毒性,适合长时间或自由活动实验。

本页供学习交流,不替代原文,也不代表原作者、期刊或资助方立场。引用科学结论请以正式发表版本为准。 图表按 CC BY(可转载,需署名) 使用。 版权声明

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