周启涛生物技术工作室
肿瘤与免疫2025/08/20· 编译自 Nature

IF50.5|STING通过ZBP1驱动不依赖TNFR1的坏死性凋亡

STING激活上调ZBP1和MLKL,形成独立于TNFR1/FADD的坏死性凋亡复合物,驱动致死性皮炎和SAVI。

STING激活上调ZBP1和MLKL,形成独立于TNFR1/FADD的坏死性凋亡复合物,驱动致死性皮炎和SAVI。

这篇按生信解读号的读法拆:先看背景和问题,再看作者怎么做、做出了哪几条硬发现,最后把数据和代码收走。

研究背景

角质形成细胞特异性缺失caspase-8(Casp8E-KO)会引发由RIPK3-MLKL坏死性凋亡驱动的致死性皮炎。此前已知,单独敲除Tnfr1仅能延迟而非阻止该疾病,提示存在TNFR1之外的坏死性凋亡途径。ZBP1作为Z型核酸(Z-DNA/Z-RNA)的感受器,在多种炎症模型中驱动坏死性凋亡,但其上游调控机制不明。同时,caspase-8缺失会导致基因组不稳定和胞质DNA积累,可能激活cGAS-STING天然免疫通路。STING功能获得性突变引起婴儿期起病的STING相关血管病变(SAVI),表现为系统性炎症和免疫失调,但坏死性凋亡在其中的作用未知。

科学问题

卡在哪里: 此前研究显示ZBP1在caspase-8缺失时上调,但驱动ZBP1表达的信号通路不清楚;STING激活是否足以启动坏死性凋亡,以及该过程是否独立于TNFR1/FADD,缺乏体内遗传学证据;STING驱动的坏死性凋亡在人类SAVI发病中的贡献尚未被评估。

本文要回答: 阐明caspase-8缺失或STING激活时,ZBP1上调的上游调控机制,验证STING是否通过ZBP1形成独立于TNFR1/FADD的坏死性凋亡复合物,并评估该通路在SAVI发病中的作用。

技术路线

作者主要用了:基因敲除小鼠模型、RNA-seq、免疫共沉淀、免疫组化、流式细胞术、细胞死亡实验

作者首先在Casp8E-KO小鼠皮肤中观察到STING、p-STAT1、ZBP1和MLKL上调,提示STING可能驱动坏死性凋亡。随后利用多种基因敲除MEFs和细胞系,通过STING激动剂/拮抗剂处理,结合免疫共沉淀和细胞死亡实验,证明STING激活足以诱导ZBP1-RIPK1-RIPK3复合物形成并增强坏死性凋亡。进一步构建角质形成细胞特异性Sting1敲除小鼠(Casp8E-KOSting1E-KO)及与Tnfr1、Zbp1的联合敲除模型,在体内验证STING独立于TNFR1驱动坏死性凋亡。最后,利用SAVI患者样本和Sting1N153S小鼠模型,评估STING驱动的坏死性凋亡在疾病中的功能。

Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用

图 1 Fig. 1。图1展示了caspase-8缺失小鼠皮肤中STING、p-STAT1、ZBP1和MLKL的上调,以及STING拮抗剂C-178对ZBP1表达的抑制。免疫共沉淀显示STING激动剂DMXAA诱导ZBP1-RIPK1-RIPK3复合物形成,且该复合物不含FADD,在Fadd−/−Mlkl−/−细胞中仍可形成,证明其独立于FADD。

核心亮点

亮点 1|STING上调ZBP1和MLKL

在Casp8E-KO小鼠皮肤和caspase-8缺失的MEFs中,STING通路激活,伴随p-STAT1、ZBP1和MLKL上调。使用STING拮抗剂C-178可完全消除STAT1磷酸化和ZBP1表达,而STING激动剂DMXAA或IFNγ处理则增强ZBP1表达。RNA-seq显示Casp8E-KO皮肤中大量ISGs上调,且富集到胞质DNA感应和STING信号通路。这些结果表明,caspase-8缺失导致cGAS-STING激活,通过IFN反应转录上调ZBP1和MLKL,为坏死性凋亡提供关键执行分子。

Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用

图 2 Fig. 2。图2比较了Casp8E-KO、Casp8E-KOTnfr1−/−和Casp8E-KOSting1E-KO小鼠的生存、体重、皮肤病理和分子标志。角质形成细胞特异性Sting1缺失与Tnfr1缺失均延迟疾病,但Sting1缺失更显著降低p-MLKL、ZBP1和p-STAT1,表明STING在角质形成细胞中驱动坏死性凋亡。

亮点 2|STING诱导ZBP1-RIPK1-RIPK3复合物

免疫共沉淀实验显示,STING激动剂DMXAA处理促进ZBP1与RIPK1、RIPK3形成复合物,该复合物不包含FADD,且可在Fadd−/−Mlkl−/− MEFs中形成,证明其独立于FADD。同时,TNF诱导的FADD-RIPK1-RIPK3复合物(复合物II)中并未检测到ZBP1。STING拮抗剂C-178抑制ZBP1表达并阻断复合物组装。此外,TNF抑制剂依那西普不能完全阻断STING增强的坏死性凋亡,而Zbp1敲除则完全消除该效应,表明STING通过ZBP1驱动不依赖TNFR1的坏死性凋亡。

Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用

图 3 Fig. 3。图3显示在Casp8E-KOTnfr1−/−背景下,杂合敲除Zbp1或Sting1仅部分延长生存,而纯合敲除则完全挽救致死性皮炎和系统性炎症。组织学分析证实纯合敲除小鼠皮肤无病变,p-MLKL和ZBP1表达消失,表明ZBP1和STING在TNFR1缺失时是坏死性凋亡的必要驱动因素。

亮点 3|体内STING独立于TNFR1驱动致死性皮炎

构建Casp8E-KOSting1E-KO小鼠,与Casp8E-KOTnfr1−/−小鼠相比,两者均延迟了致死性皮炎的发生,但Casp8E-KOSting1E-KO小鼠存活至P11,略优于Tnfr1缺失。组织学分析显示,角质形成细胞特异性Sting1缺失显著减少p-MLKL、ZBP1和p-STAT1阳性细胞,而Tnfr1缺失仅部分降低。进一步在Casp8E-KOTnfr1−/−背景下共敲除Zbp1或Sting1,均能完全挽救致死性皮炎和系统性炎症,表明STING和ZBP1在TNFR1缺失时仍能驱动致死性坏死性凋亡。

Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用

图 4 Fig. 4。图4展示了Casp8E-KOSting1−/−小鼠比Casp8E-KOTnfr1−/−存活更长,而Casp8E-KOZbp1−/−小鼠无保护,提示STING同时调控TNFR1和ZBP1两条坏死性凋亡途径。Casp8E-KOTnfr1−/−Sting1−/−小鼠完全健康,证明STING在非角质形成细胞中也发挥作用。此外,Casp8E-KOCgas−/−小鼠表型与Sting1缺失一致,而Mavs缺失无影响,表明cGAS是上游传感器。

亮点 4|cGAS-STING感知基因组DNA

Casp8E-KOCgas−/−小鼠完全重现Casp8E-KOSting1−/−小鼠的保护表型,而Casp8E-KOMavs−/−小鼠无改善,表明STING激活完全依赖cGAS。免疫荧光显示caspase-8缺失细胞中胞质DNA积累,但不与线粒体标志物TFAM共定位;mtDNA耗竭处理不能降低ZBP1表达或ISG转录。皮肤组织中出现有丝分裂异常和γH2AX灶,提示基因组不稳定导致核DNA泄漏至胞质,作为cGAS的配体。

Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用

图 5 Fig. 5。图5显示SAVI患者样本中IFN反应基因、ZBP1和MLKL上调,且与Casp8E-KO小鼠转录组有显著重叠。在Sting1N153S小鼠中,Ripk3共敲除完全阻止致死性,消除p-MLKL染色,并改善多器官炎症和免疫细胞异常,证明STING驱动的坏死性凋亡是SAVI的关键致病机制。

亮点 5|STING促进Z核酸积累激活ZBP1

在caspase-8缺失的MEFs中检测到胞质Z-DNA和Z-RNA积累,且ZBP1与Z核酸共定位。STING激动剂DMXAA进一步增强Z核酸信号强度,表明STING不仅上调ZBP1表达,还促进其配体Z核酸的积累或稳定,从而激活ZBP1。这解释了为何STING激活足以在无外源Z核酸刺激下启动坏死性凋亡。

亮点 6|STING驱动的坏死性凋亡在SAVI中致病

SAVI患者全血RNA-seq显示IFN反应基因、ZBP1和MLKL上调,且与Casp8E-KO小鼠转录组有73%的通路重叠。在Sting1N153S小鼠模型中,Ripk3共敲除完全阻止致死性,消除p-MLKL染色,并显著改善皮肤、肺、胸腺和脾脏的炎症及免疫细胞异常。这表明STING功能获得性突变通过RIPK3依赖的坏死性凋亡驱动SAVI的病理,靶向该通路具有治疗潜力。

生信可带走

这一块是给做分析的人用的,不是科普点缀。

  • 方法栈: 基因敲除小鼠模型、RNA-seq、免疫共沉淀、免疫组化、流式细胞术、细胞死亡实验
  • 公开数据: 原文未给出公开组学登录号
  • 代码: 原文未给出公开 GitHub/GitLab 仓库
  • 谁该点开原文: 研究细胞死亡、天然免疫、自身炎症性疾病或STING通路的研究者,以及关注坏死性凋亡与疾病机制的生信分析人员。

带走一句

STING不仅是IFN反应的上游,还能直接通过ZBP1启动不依赖TNFR1的坏死性凋亡;分析STING相关疾病时,应同时关注坏死性凋亡标志物和ZBP1表达。

本页供学习交流,不替代原文,也不代表原作者、期刊或资助方立场。引用科学结论请以正式发表版本为准。 图表按 CC BY(可转载,需署名) 使用。 版权声明

微信二维码

需要同类分析?扫码加微信,一对一沟通需求,交付后终身售后。

添加微信

需要同类分析?扫码加微信,一对一沟通需求,交付后终身售后。