周启涛生物技术工作室
肿瘤与免疫2024/11/14· 编译自 Nature

IF50.5|可溶性配体感应受体SNIPR:工程化细胞通讯与疾病感知

SNIPR受体突破传统Notch限制,可感应可溶性配体,实现CAR-T肿瘤局部激活与正交细胞通讯。

SNIPR受体突破传统Notch限制,可感应可溶性配体,实现CAR-T肿瘤局部激活与正交细胞通讯。

这篇按生信解读号的读法拆:先看背景和问题,再看作者怎么做、做出了哪几条硬发现,最后把数据和代码收走。

研究背景

哺乳动物合成生物学中,缺乏能稳健响应可溶性配体并激活定制功能的模块化合成受体。现有受体如CAR-T、synNotch主要针对细胞表面靶标,对可溶性因子如TGFβ、VEGF等感应能力有限。可溶性因子在发育、免疫和肿瘤微环境中至关重要,工程细胞若能感应这些因子,将极大扩展治疗和基础研究应用。此前虽有MESA、TanGo、ChaCha、PAGER、OCAR等系统尝试解决,但存在多组分、灵敏度低或配体选择不灵活等问题。SNIPR是一种基于Notch架构的紧凑单链受体,此前已被证明可响应膜结合配体,但其对可溶性配体的响应能力未知。

科学问题

卡在哪里: 现有合成受体难以同时满足紧凑单链、模块化配体感应、低背景高激活等要求,且对可溶性配体响应差。synNotch因依赖机械力无法被可溶性配体激活,而其他系统如MESA、GPCR融合受体存在多组分、灵敏度不足或配体选择受限等问题。

本文要回答: 本文旨在验证SNIPR能否被可溶性配体激活,并探索其在治疗性细胞(如CAR-T)和正交细胞通讯中的应用。

技术路线

作者主要用了:流式细胞术、共聚焦显微镜、化学抑制剂、ELISA、Luminex、小鼠异种移植模型

作者首先构建了针对TGFβ、VEGF等可溶性因子的SNIPR受体,并在原代T细胞中验证其激活能力,与synNotch对比。随后通过化学抑制剂和共聚焦成像探究激活机制,发现依赖内吞和酸性环境。进一步利用计算设计的正交异二聚体构建orthoSNIPR系统,实现细胞间私有通讯。最后在体外共培养和小鼠肿瘤模型中验证SNIPR→CAR电路的治疗潜力和安全性。

Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用

图 1 Fig. 1。图1展示SNIPR平台的应用前景和可溶性配体激活能力。b中TGFβ SNIPR在加入TGFβ1后激活BFP报告基因,而synNotch无响应;c中VEGF SNIPR对VEGF有剂量依赖性激活;d显示FGF2和IFNγ SNIPR也能被激活;e中orthoSNIPR对合成异二聚体配体响应。

核心亮点

亮点 1|SNIPR可被可溶性配体激活

原代T细胞中,TGFβ SNIPR和VEGF SNIPR在加入重组配体后显著激活BFP报告基因,而synNotch无响应。SNIPR激活具有配体特异性和剂量依赖性,且对TGFβ活性形式敏感。此外,针对FGF2和IFNγ的SNIPR也成功构建,表明平台可扩展至多种可溶性靶标。

Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用

图 2 Fig. 2。图2揭示SNIPR激活机制。a示意潜在激活途径和抑制剂靶点;b显示可溶性SNIPR对氯喹敏感,而膜结合受体对ADAM抑制剂敏感;c-e共聚焦图像显示配体结合后SNIPR与配体共定位并内化至溶酶体;f中DmrA结构域诱导二聚化可模拟配体激活。

亮点 2|内吞-酸性环境依赖的激活机制

化学抑制剂实验显示,可溶性SNIPR激活不受ADAM蛋白酶抑制剂影响,但被内吞酸化抑制剂氯喹显著抑制,而膜结合synNotch和SNIPR则依赖ADAM。共聚焦成像证实配体结合后SNIPR与配体共内化至溶酶体。配体诱导的受体二聚化可能是内吞触发因素,通过DmrA结构域诱导二聚化可模拟配体激活。

Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用

图 3 Fig. 3。图3展示orthoSNIPR系统的可调性和通讯网络。a中不同价态和几何结构的配体产生不同激活强度和EC50;b中五个异二聚体对形成正交或交叉反应通道;c中orthoTuner剂量依赖性抑制信号;d-e中EndoTagged配体增强激活;f中发送细胞分泌配体激活接收细胞。

亮点 3|正交SNIPR系统实现私有通讯

利用计算设计的LHD异二聚体构建orthoSNIPR,受体与配体亚基完全正交,不干扰天然信号。通过改变配体价态和几何结构可调节信号强度。构建了五个异二聚体对,其中三对完全正交,两对交叉反应,可形成私有或混杂通讯通道。此外,设计了orthoTuner作为抑制因子,实现条件性信号调控。

Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用

图 4 Fig. 4。图4展示SNIPR对肿瘤细胞分泌因子的感应和体外杀伤。a示意共培养实验;b中TGFβ SNIPR T细胞对分泌TGFβ的肿瘤细胞激活,与ELISA数据相关;c中VEGF SNIPR对A549细胞异常高激活;d中transwell实验消除接触后激活模式与分泌量一致;e中阻断抗体抑制激活;f-g中SNIPR→CAR T细胞有效杀伤A549细胞。

亮点 4|SNIPR→CAR电路限制肿瘤外毒性

在体外共培养中,TGFβ SNIPR T细胞对分泌TGFβ的肿瘤细胞系激活,且激活水平与配体分泌量相关。在小鼠A549和A375异种移植模型中,SNIPR→HER2 CAR T细胞有效控制肿瘤生长,而组成型表达HER2 CAR的T细胞导致严重体重下降。使用交叉反应DARPin CAR时,SNIPR电路显著提高治疗窗口,避免肺毒性。

Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用

图 5 Fig. 5。图5展示SNIPR→CAR电路在体内限制毒性并控制肿瘤。a示意实验设计;b中组成型DARPin CAR导致小鼠体重下降,而SNIPR电路维持体重并控制A549肿瘤;c中在A375模型中,SNIPR→trCAR电路耐受良好且有效,组成型trCAR导致体重下降且肿瘤失控。

生信可带走

这一块是给做分析的人用的,不是科普点缀。

  • 方法栈: 流式细胞术、共聚焦显微镜、化学抑制剂、ELISA、Luminex、小鼠异种移植模型
  • 公开数据: 原文未给出公开组学登录号
  • 代码: 原文未给出公开 GitHub/GitLab 仓库
  • 谁该点开原文: 从事合成生物学、细胞治疗、肿瘤免疫和受体工程的研究人员。

带走一句

SNIPR提供了一种紧凑、模块化的可溶性配体感应平台,可赋予工程细胞环境感知能力,用于精准治疗和合成生物学。

本页供学习交流,不替代原文,也不代表原作者、期刊或资助方立场。引用科学结论请以正式发表版本为准。 图表按 CC BY(可转载,需署名) 使用。 版权声明

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