周启涛生物技术工作室
肿瘤与免疫2024/09/04· 编译自 Nature

IF50.5|睾酮治疗重塑跨性别男性免疫:IFN-I/TNF轴交叉调控

睾酮抑制I型干扰素、增强TNF反应,重塑跨性别男性免疫系统。

睾酮抑制I型干扰素、增强TNF反应,重塑跨性别男性免疫系统。

这篇按生信解读号的读法拆:先看背景和问题,再看作者怎么做、做出了哪几条硬发现,最后把数据和代码收走。

研究背景

男性和女性在感染、炎症和自身免疫病中表现出显著差异:男性对SARS-CoV-2感染死亡率更高,而女性更易患自身免疫病且疫苗反应更强。这些差异源于遗传、激素和行为因素,但激素的相对贡献尚不清楚。性别肯定激素治疗(GAHT)为研究性激素在人体内的免疫调节作用提供了独特机会。跨性别男性(出生时被指定为女性,接受睾酮治疗)体内激素水平发生剧烈变化,但其免疫学后果缺乏系统研究。

科学问题

卡在哪里: 尽管已知性激素影响免疫反应,但缺乏在人体内直接观察性激素动态调节免疫系统的纵向研究。此前研究多基于动物模型或横断面比较,无法区分激素的直接效应与遗传或环境因素。跨性别男性接受睾酮治疗提供了理想的人体模型,但相关免疫学数据极为有限。

本文要回答: 本文旨在通过纵向多组学分析,系统揭示睾酮治疗对跨性别男性免疫系统的动态影响,并阐明其调控的分子机制。

技术路线

作者主要用了:scRNA-seq、sc-ATAC-seq、质谱流式、Olink蛋白组、RNA-seq、流式细胞术

作者对23名跨性别男性在睾酮治疗前、治疗后3个月和12个月进行纵向采样,结合血清激素检测、全血RNA-seq、50参数质谱流式、scRNA-seq、sc-ATAC-seq和血浆蛋白组学,系统评估免疫细胞组成、表型、功能和表观遗传变化。并通过体外实验(DHT、AR抑制剂、ESR抑制剂)区分雄激素和雌激素信号的相对贡献。最后利用公开数据集验证发现。

Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 1 · 原文图,按文末许可署名使用

图 1 Fig. 1。图1展示研究设计和血清激素变化:23名跨性别男性在基线、3个月和12个月采样,生物可利用睾酮升至男性范围,雌二醇和孕酮下降。全血RNA-seq显示IFNα通路基因下调,TNF/NFκB通路基因上调。

核心亮点

亮点 1|睾酮抑制pDC的IFN-I反应

质谱流式显示pDC频率在睾酮治疗后显著下降。scRNA-seq分析R848刺激的pDC发现,ISG(ISG20、PAPR14、SP110、MX1)诱导减弱,Hallmark IFNα基因集和M127 IFN-I反应模块显著下调。IRF7 mRNA下调,而负调控因子SOCS3上调,并与IFNα反应负相关。体外实验证实DHT通过AR信号诱导SOCS1和SOCS3,抑制IFN-I反应。

Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 2 · 原文图,按文末许可署名使用

图 2 Fig. 2。图2展示质谱流式结果:113个免疫细胞簇中,pDC、CD8+ MAIT和CD24+CD8+ TCM频率下降。pDC表型改变,CD81表达增加。R848刺激后pDC的ISG诱导减弱,SOCS3上调。

亮点 2|睾酮增强单核细胞TNF反应

与IFN-I抑制相反,睾酮治疗后单核细胞对LPS和R848刺激的TNF反应增强。Hallmark TNF通路基因(IL-1、IL-6、TNF、NFKB1)诱导更强。血浆TNF家族蛋白(TNF、RANKL、TNFSFR9、TRAIL)升高。SLAMF7在单核细胞和T细胞中上调,且SLAMF7+单核细胞TNF反应更强。体外实验显示DHT通过AR信号增强NFKB1诱导,而ESR抑制剂无此效应。

Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 3 · 原文图,按文末许可署名使用

图 3 Fig. 3。图3展示单核细胞功能变化:R848和LPS刺激后,单核细胞TNF反应增强,IFNα反应减弱。SLAMF7+单核细胞TNF反应更强。体外实验显示DHT通过AR增强NFKB1,而ESR抑制剂无此效应。

亮点 3|NK细胞IFNγ反应增强

NicheNet分析预测单核细胞来源的IL-6、TNF、IL-15、IL-12B驱动NK细胞和CD8+ T细胞中基因表达变化。PMA/ionomycin刺激后,NK细胞IFNγ产生在睾酮治疗后增强,而T细胞无变化。sc-ATAC-seq显示T/NK细胞中经典NFκB结合位点染色质可及性增加。体外实验证实DHT通过AR信号增强CD56dim NK细胞IFNγ反应。

Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 4 · 原文图,按文末许可署名使用

图 4 Fig. 4。图4展示NicheNet分析和sc-ATAC-seq结果:单核细胞来源的IL-6、TNF、IL-15、IL-12B预测驱动NK和CD8+ T细胞基因变化。T/NK细胞中经典NFκB结合位点染色质可及性增加。NK细胞IFNγ反应增强。

亮点 4|表观遗传重塑NFκB通路

sc-ATAC-seq分析显示,睾酮治疗12个月后,T细胞和NK细胞中经典NFκB转录因子结合位点的染色质可及性显著增加,而非经典NFκB(RELB)无变化。STAT1、STAT2、STAT3、AP-1和MAPK结合位点无显著变化。表明睾酮通过表观遗传机制增强经典NFκB信号,可能由单核细胞TNF反应增强介导。

Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用
Fig. 5 · 原文图,按文末许可署名使用

图 5 Fig. 5。图5展示公开数据验证:SARS-CoV-2感染患者中男性单核细胞TNF反应更高,女性pDC IFN-I反应更强。健康志愿者刺激实验中,男性SLAMF7+单核细胞频率更高,mTB刺激24小时后男性NK细胞IFNγ反应更强。

亮点 5|公开数据验证性别差异

在SARS-CoV-2感染患者和健康志愿者刺激实验中,男性单核细胞TNF反应高于女性,而女性pDC和单核细胞IFN-I反应更强。男性SLAMF7+单核细胞频率更高,且TNF反应更强。mTB刺激24小时后,男性NK细胞IFNγ反应高于女性,与睾酮效应一致。

生信可带走

这一块是给做分析的人用的,不是科普点缀。

带走一句

性激素动态调控IFN-I/TNF轴,分析免疫数据时应考虑激素状态,尤其是跨性别或激素治疗人群。

本页供学习交流,不替代原文,也不代表原作者、期刊或资助方立场。引用科学结论请以正式发表版本为准。 图表按 CC BY(可转载,需署名) 使用。 版权声明

微信二维码

需要同类分析?扫码加微信,一对一沟通需求,交付后终身售后。

添加微信

需要同类分析?扫码加微信,一对一沟通需求,交付后终身售后。